216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0866 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  100 
 
 		 413 aa  792    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 413 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 415 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 415 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  40.05 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 414 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  41.84 
 
 		 457 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  41.87 
 
 		 423 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  41.87 
 
 		 423 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0886  RhtX/FptX family siderophore transporter  41.87 
 
 		 423 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47536  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0880  putative transporter  42.52 
 
 		 414 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  42.26 
 
 		 414 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 396 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 411 aa  123  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 465 aa  113  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 416 aa  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  29.31 
 
 		 429 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  29.31 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  30.3 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  34.26 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  30.55 
 
 		 420 aa  106  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  30.62 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  33.04 
 
 		 418 aa  103  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  29.35 
 
 		 426 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 416 aa  97.1  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 412 aa  96.7  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 447 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0830  hypothetical protein  25.94 
 
 		 415 aa  92.8  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0856  hypothetical protein  25.94 
 
 		 419 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 388 aa  90.5  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2102  yersinabactin region putative transporter YbtX  28.27 
 
 		 426 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  28.35 
 
 		 492 aa  89.7  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  28.35 
 
 		 492 aa  89.7  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  28.9 
 
 		 492 aa  89.7  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  28.35 
 
 		 492 aa  89.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  25.31 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  27.13 
 
 		 437 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 437 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 437 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 439 aa  86.3  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  25.94 
 
 		 428 aa  86.7  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  26.75 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  26.75 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  26.75 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  26.75 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  27.67 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  27.67 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  28.57 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  35.37 
 
 		 511 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  27.25 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  28.53 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  27.25 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  27.67 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  27.67 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  27.67 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  27.67 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  27.67 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  27.01 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  26.23 
 
 		 464 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  40.27 
 
 		 515 aa  81.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  27.14 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  28.19 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  25.27 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  27.95 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  26.56 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  25.41 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04836  SD08430p (AFU_orthologue; AFUA_3G07290)  25.87 
 
 		 576 aa  77.4  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 473 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  25.41 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  26.32 
 
 		 495 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33225  Acetyl-CoA transporter  29.11 
 
 		 560 aa  76.6  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.568918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 463 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  27.17 
 
 		 491 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>