210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2158 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  816    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  87.65 
 
 		 414 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  96.05 
 
 		 457 aa  675    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  87.34 
 
 		 415 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  87.34 
 
 		 415 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0886  RhtX/FptX family siderophore transporter  99.29 
 
 		 423 aa  811    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  100 
 
 		 423 aa  816    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  87.1 
 
 		 415 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  67.93 
 
 		 413 aa  485  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  72.68 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0880  putative transporter  72.68 
 
 		 414 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 413 aa  250  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  34.33 
 
 		 271 aa  103  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 406 aa  93.2  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 465 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 416 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 396 aa  89.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 461 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  33.22 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  35.82 
 
 		 511 aa  86.3  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  36.06 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  27.96 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  25.7 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  27.82 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  30.52 
 
 		 515 aa  76.6  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  28.87 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  28.87 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 475 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  25.61 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  25 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 504 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  34.2 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04836  SD08430p (AFU_orthologue; AFUA_3G07290)  31.45 
 
 		 576 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33225  Acetyl-CoA transporter  23.6 
 
 		 560 aa  71.6  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.568918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  26 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  25.72 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  26.99 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  27.68 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0025  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00511907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  27.51 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  25.62 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 		 517 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  25.61 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  24.57 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  24.57 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 517 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  27 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  26.64 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 		 517 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  24.83 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  26.26 
 
 		 491 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  25.34 
 
 		 491 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  26.26 
 
 		 491 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  25.34 
 
 		 491 aa  67  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  26.26 
 
 		 491 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  25.34 
 
 		 491 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  25.34 
 
 		 491 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  26.64 
 
 		 429 aa  67  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  26.33 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  24.48 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  30.94 
 
 		 550 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  27.51 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  39.1 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 641 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  28.84 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  25.52 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  25.42 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  25.42 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  24.56 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>