204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1571 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 412 aa  826    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 		 406 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 424 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  38.67 
 
 		 408 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0344  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  31.42 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 641 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 408 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  33.09 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 415 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 415 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  29.96 
 
 		 418 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  32.75 
 
 		 457 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 418 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  30.5 
 
 		 423 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  31.05 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0886  RhtX/FptX family siderophore transporter  30.5 
 
 		 423 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  30.5 
 
 		 423 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0880  putative transporter  31.41 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 465 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 406 aa  94  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  29.86 
 
 		 271 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 424 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  29.96 
 
 		 491 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  29.96 
 
 		 491 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  29.6 
 
 		 491 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  29.6 
 
 		 491 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  29.6 
 
 		 491 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  29.6 
 
 		 491 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  29.6 
 
 		 491 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  29.6 
 
 		 491 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  29.6 
 
 		 491 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  27.44 
 
 		 491 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  28.12 
 
 		 409 aa  87.4  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  29.39 
 
 		 492 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  29.15 
 
 		 420 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  30.9 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  25.7 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1955  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  27.5 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 504 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  29.6 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  29.6 
 
 		 493 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  29.6 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  24.66 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  29.6 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  29.6 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  27.24 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  27.64 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  23.88 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  29.01 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  27.64 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  25.31 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  27.24 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  27.24 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  27.24 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  27.64 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  27.24 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  28.63 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  27.73 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  27.73 
 
 		 495 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1304  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 461 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  26.1 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  29.01 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  28.29 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  27.84 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0147  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 550 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  27.18 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>