211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1498 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  789    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  55.16 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  45.53 
 
 		 406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  39.2 
 
 		 412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0344  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  36.98 
 
 		 641 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 408 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 395 aa  126  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 424 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 465 aa  110  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  30.73 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  29.83 
 
 		 428 aa  99.4  9e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  30.8 
 
 		 271 aa  99.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  29.74 
 
 		 491 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  29.71 
 
 		 491 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  29.63 
 
 		 491 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  29.63 
 
 		 491 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  29.71 
 
 		 491 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.35 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  29.63 
 
 		 491 aa  98.6  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  29.63 
 
 		 491 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  29.74 
 
 		 491 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  29.63 
 
 		 491 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  29.18 
 
 		 495 aa  96.3  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  28.53 
 
 		 492 aa  96.3  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  28.61 
 
 		 492 aa  96.3  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  28.53 
 
 		 492 aa  96.3  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  29.28 
 
 		 495 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  28.61 
 
 		 489 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  28.66 
 
 		 491 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  29.74 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  29.91 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  27.46 
 
 		 437 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  28.66 
 
 		 429 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  30.04 
 
 		 464 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  27.46 
 
 		 437 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  29.5 
 
 		 464 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1955  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 437 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 437 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  27.46 
 
 		 437 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 464 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  27.46 
 
 		 437 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  27.46 
 
 		 437 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  27.46 
 
 		 437 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  28.66 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  28.35 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 473 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 473 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 473 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 473 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  29.39 
 
 		 419 aa  86.3  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  29.63 
 
 		 493 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  29.63 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  29.63 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 473 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  29.63 
 
 		 493 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  29.63 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  28 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  29.94 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2102  yersinabactin region putative transporter YbtX  28.68 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1629  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00218526  hitchhiker  0.00000020409 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1961  AmpG permease protein, putative  26.56 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1304  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 517 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 517 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 517 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4105  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 547 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000015602 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0139  beta-lactamase induction signal transducer protein  35.29 
 
 		 509 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143308  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  31.23 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0856  hypothetical protein  22.99 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0830  hypothetical protein  22.73 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4964  putative permease  31.4 
 
 		 594 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559843  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  35.26 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  31.25 
 
 		 511 aa  70.1  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  28.14 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57100  putative permease  31.4 
 
 		 594 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>