183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0688 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  97.7 
 
 		 428 aa  820    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  100 
 
 		 434 aa  862    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  29.2 
 
 		 271 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  27.49 
 
 		 418 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  28.31 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 408 aa  107  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2102  yersinabactin region putative transporter YbtX  27.34 
 
 		 426 aa  97.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 418 aa  96.7  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 396 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 413 aa  94  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 417 aa  90.9  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 465 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  27.63 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 517 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  25.72 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  30.71 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 517 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 473 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 517 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  26.15 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  25.44 
 
 		 492 aa  73.6  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  26.15 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0880  putative transporter  30.2 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 473 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 473 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 473 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1955  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  normal  0.0965293 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  26.15 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  26.15 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  26.15 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  26.15 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 641 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  26.15 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  26.15 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  25.87 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  26.15 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  23.86 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  22.88 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  27.06 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  27.06 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0886  RhtX/FptX family siderophore transporter  27.91 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47536  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  27.2 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  27.24 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 459 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  24.72 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  24.72 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0025  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00511907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  24.3 
 
 		 492 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  24.72 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  24.72 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  24.72 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  24.3 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  24.3 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  24.83 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  24.83 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  27.24 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  24.83 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  24.83 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  24.83 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  25.44 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1645  AmpG protein  23.44 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1304  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  25.09 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  26.15 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1618  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  25 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  24.72 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  27.04 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  26.49 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  24.47 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  21.51 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  25.85 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  23.25 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1437  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  22.07 
 
 		 475 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>