222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5064 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  100 
 
 		 418 aa  793    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  66.26 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  39.23 
 
 		 408 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 395 aa  159  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 418 aa  126  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 416 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 406 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 424 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 428 aa  123  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 413 aa  122  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  31.54 
 
 		 271 aa  110  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2102  yersinabactin region putative transporter YbtX  30.19 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  29.41 
 
 		 433 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  29.07 
 
 		 433 aa  102  9e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  27.47 
 
 		 437 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  27.47 
 
 		 437 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  27.47 
 
 		 437 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  27.47 
 
 		 437 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 437 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 437 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  27.47 
 
 		 437 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1955  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 464 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  37.5 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  26.67 
 
 		 426 aa  97.4  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 424 aa  97.4  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  24.66 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 464 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  27.15 
 
 		 426 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  35.19 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  26.11 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  35.69 
 
 		 413 aa  94.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  28.25 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  25.59 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  25.55 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  26.89 
 
 		 447 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  28.92 
 
 		 492 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  35.36 
 
 		 457 aa  90.5  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 422 aa  89.7  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 412 aa  89.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 473 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 416 aa  88.2  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0880  putative transporter  37.5 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 473 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 408 aa  86.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 447 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  28.04 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  36.17 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0344  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0886  RhtX/FptX family siderophore transporter  36.17 
 
 		 423 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  36.17 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  27.56 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  27.56 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  27.56 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0856  hypothetical protein  26.4 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0830  hypothetical protein  26.4 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  27.56 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  27.56 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  27.56 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  27.56 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  27.56 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  27.56 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  26.29 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  26.46 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  27.34 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  27.34 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  27.34 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  25.71 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  26.8 
 
 		 495 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  27.89 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  36.52 
 
 		 511 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  25.93 
 
 		 489 aa  80.9  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  24.71 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  27.03 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0395  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 517 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  24.75 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  29.26 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>