217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0880 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  97.34 
 
 		 414 aa  681    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0880  putative transporter  100 
 
 		 414 aa  791    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  74.43 
 
 		 413 aa  557  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  70.42 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  70.42 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  70.42 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  71.89 
 
 		 414 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  72.92 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  72.7 
 
 		 457 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  72.92 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0886  RhtX/FptX family siderophore transporter  72.66 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47536  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 413 aa  242  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  36.25 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  37.41 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  35.55 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 412 aa  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 424 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  28.03 
 
 		 466 aa  95.9  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 408 aa  93.2  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 416 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  38.55 
 
 		 511 aa  92.8  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 388 aa  90.9  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 465 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 447 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 465 aa  89  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  28.16 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 443 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  28.54 
 
 		 466 aa  87.8  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 459 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  28.17 
 
 		 428 aa  87  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  26.59 
 
 		 464 aa  87  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 416 aa  86.7  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 428 aa  86.3  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  28.48 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  26.73 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  26.86 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  24.95 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  26.86 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  26.58 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  26.91 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  26.91 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  26.91 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  26.91 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  26.91 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  26.58 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 476 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  26.62 
 
 		 437 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  26.62 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  26.62 
 
 		 437 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  26.62 
 
 		 437 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  26.62 
 
 		 437 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  24.54 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  28.72 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  25.82 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  25.82 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  29 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  25.82 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  35.36 
 
 		 550 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  28.72 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  25.68 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 454 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  26.58 
 
 		 491 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  26.58 
 
 		 491 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  31.71 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  28.12 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  26.51 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04836  SD08430p (AFU_orthologue; AFUA_3G07290)  34.97 
 
 		 576 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33225  Acetyl-CoA transporter  32.93 
 
 		 560 aa  77.8  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.568918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  32.58 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 504 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>