178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0344 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0344  major facilitator transporter  100 
 
 		 415 aa  834    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 424 aa  225  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 408 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 641 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 408 aa  106  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  28 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  25.93 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1955  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  24.79 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  24.38 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  25.9 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 447 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  22.52 
 
 		 492 aa  79.7  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  25.38 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  23.55 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  23.55 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  23.55 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  23.97 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1437  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  26.37 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  25.97 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  23.05 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  25.51 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  25.51 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  26.01 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  25.51 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  25.51 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  25.51 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  25.51 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  25.51 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  25.51 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  25.51 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  26.35 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  25.09 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  25 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  22 
 
 		 482 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  23.16 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  21.75 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  24.9 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  22.87 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  24.38 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  21.31 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  21.31 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  21.31 
 
 		 491 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  21.31 
 
 		 491 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  21.31 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  24.25 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  24.25 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  25 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  24.25 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  24.25 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  24.25 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2601  hypothetical protein  24.44 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0722822  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0856  hypothetical protein  24.24 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0830  hypothetical protein  22.62 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 517 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  25.31 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  22.87 
 
 		 550 aa  60.5  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1629  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00218526  hitchhiker  0.00000020409 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1961  AmpG permease protein, putative  23.15 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0655  major facilitator superfamily transporter  23.46 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  21.99 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 517 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 553 aa  58.2  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2436  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.649035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  21.1 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  25.07 
 
 		 449 aa  57  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>