80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0655 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0655  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 427 aa  794    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0395  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 411 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 396 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 396 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  24.32 
 
 		 492 aa  73.2  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  24.32 
 
 		 492 aa  73.2  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  24.32 
 
 		 492 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  25.68 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0344  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  31.52 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  26.42 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  26.15 
 
 		 495 aa  70.1  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  24.78 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  37.13 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  24.66 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  24.66 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  24.66 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  24.66 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  24.66 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  24.66 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  24.66 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  25.47 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  25.47 
 
 		 493 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  25.47 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  25.47 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  25.47 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1955  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 641 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  26.63 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  24.39 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  24.39 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  23.37 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  26.39 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  28.77 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  26.75 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  23.17 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  26.75 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  28.13 
 
 		 426 aa  53.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  24.93 
 
 		 489 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  25.35 
 
 		 489 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  29.3 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  22.87 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 447 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  26.53 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 422 aa  48.5  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 414 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  22.69 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 517 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  20.17 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  27.38 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  28.52 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 471 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 517 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  27.16 
 
 		 414 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 471 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1060  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 467 aa  43.5  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0118336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1298  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 442 aa  43.1  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 471 aa  43.1  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>