264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3267 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 641 aa  1254    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  40.75 
 
 		 406 aa  220  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 412 aa  154  7e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 408 aa  152  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 396 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 396 aa  137  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 416 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0344  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 415 aa  125  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 408 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 411 aa  111  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  35.19 
 
 		 271 aa  105  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 465 aa  100  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 406 aa  99.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  31.08 
 
 		 419 aa  97.8  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  28.08 
 
 		 433 aa  94.4  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  33.2 
 
 		 412 aa  94.4  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  27.79 
 
 		 433 aa  92.8  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 417 aa  90.9  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  30.72 
 
 		 429 aa  90.9  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  30.72 
 
 		 429 aa  90.5  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 		 424 aa  90.5  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1424  cupin 2 domain-containing protein  37.61 
 
 		 123 aa  89.7  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.000000123197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  30.39 
 
 		 426 aa  89  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 418 aa  88.2  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 447 aa  87.4  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  30.77 
 
 		 426 aa  87  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  27.76 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3531  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.54 
 
 		 125 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0222774 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.58 
 
 		 125 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  30.97 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  30.97 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  30.97 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  30.97 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  30.97 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  30.97 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  30.97 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  30.97 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  30.97 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  27.78 
 
 		 492 aa  83.2  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 473 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 473 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 415 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 473 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 415 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  28.75 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 473 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  28.75 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.45 
 
 		 119 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  28.75 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  29.45 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 517 aa  81.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.82 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 517 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1451  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 124 aa  80.9  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.28609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 517 aa  80.5  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  29.57 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  28.9 
 
 		 495 aa  80.1  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  29.57 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  29.57 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  29.57 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 464 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  28.53 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  26.37 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  28.25 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4683  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.71 
 
 		 124 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  9.43245e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1032  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.19 
 
 		 121 aa  77.8  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.09 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5232  hypothetical protein  38.32 
 
 		 131 aa  77.4  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.234619 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2296  cupin domain-containing protein  36.46 
 
 		 126 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  27.69 
 
 		 420 aa  76.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2876  cupin 2 domain-containing protein  36.13 
 
 		 131 aa  75.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0880  putative transporter  32.09 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1711  hypothetical protein  35.79 
 
 		 126 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0711827  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0760  cupin domain-containing protein  35.79 
 
 		 126 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558257  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  28.48 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2435  cupin domain-containing protein  35.79 
 
 		 126 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3332  cyclic nucleotide-binding protein  41.3 
 
 		 130 aa  74.3  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  31.02 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  26.11 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1629  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00218526  hitchhiker  0.00000020409 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1961  AmpG permease protein, putative  26.01 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0215  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.05 
 
 		 127 aa  73.9  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>