223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4494 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  100 
 
 		 416 aa  790    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  36.52 
 
 		 396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 		 424 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 465 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 		 411 aa  187  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  39.65 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  30.53 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 422 aa  153  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 417 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  33.85 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 388 aa  150  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  29.19 
 
 		 491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  29.19 
 
 		 491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  29.19 
 
 		 491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  29.19 
 
 		 491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  29.19 
 
 		 491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  29.19 
 
 		 491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  29.19 
 
 		 491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  29.19 
 
 		 491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  28.95 
 
 		 491 aa  146  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  29.54 
 
 		 492 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  29.6 
 
 		 495 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  30.1 
 
 		 495 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  30.29 
 
 		 429 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  29.84 
 
 		 428 aa  143  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  28.39 
 
 		 437 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  28.36 
 
 		 492 aa  143  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 437 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 437 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 395 aa  143  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  30.03 
 
 		 429 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  28.39 
 
 		 437 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  28.39 
 
 		 437 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  28.39 
 
 		 437 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  28.39 
 
 		 437 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  28.36 
 
 		 492 aa  142  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  28.54 
 
 		 437 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  28.36 
 
 		 492 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  32.77 
 
 		 409 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 425 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  30.29 
 
 		 426 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  29.35 
 
 		 491 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  29.35 
 
 		 491 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  29.35 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  29.35 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  29.35 
 
 		 491 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  28.42 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  27.99 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  30.13 
 
 		 419 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 641 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  34.06 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  29.62 
 
 		 489 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 416 aa  130  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  26.48 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  30.41 
 
 		 489 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 424 aa  126  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2102  yersinabactin region putative transporter YbtX  30.4 
 
 		 426 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 473 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 473 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 473 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 464 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 473 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1961  AmpG permease protein, putative  27.82 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1629  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00218526  hitchhiker  0.00000020409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 461 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 456 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  25.59 
 
 		 433 aa  119  9e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 457 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  28.54 
 
 		 466 aa  119  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  25.59 
 
 		 433 aa  119  9e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  28.94 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1309  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 475 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.327307  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  28.68 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  25.3 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 517 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 517 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  28.31 
 
 		 439 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.47 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>