91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0840 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  100 
 
 		 439 aa  852    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2102  yersinabactin region putative transporter YbtX  40 
 
 		 426 aa  253  5.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 418 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  34.11 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  30.26 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2436  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.649035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 396 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 396 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1437  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2601  hypothetical protein  28.49 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0722822  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  31.17 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 416 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  27.31 
 
 		 271 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 411 aa  87.4  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 465 aa  84  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  30.4 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0886  RhtX/FptX family siderophore transporter  30.4 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47536  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  30.13 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  30.4 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0155  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 247 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  26.34 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  25.75 
 
 		 409 aa  67  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  26.08 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  31.49 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0880  putative transporter  30.03 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0377  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0179804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 641 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  24.45 
 
 		 491 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  24.45 
 
 		 491 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1955  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  24.45 
 
 		 491 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  24.45 
 
 		 491 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  24.45 
 
 		 491 aa  53.9  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  24.45 
 
 		 491 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  24.45 
 
 		 491 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  24.45 
 
 		 491 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  24.45 
 
 		 491 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 504 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 388 aa  53.5  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  25.45 
 
 		 426 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  27.27 
 
 		 511 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  26.09 
 
 		 428 aa  50.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1426  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 339 aa  50.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0344  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 411 aa  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1645  AmpG protein  21.43 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0012  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0411083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  24.46 
 
 		 439 aa  47.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1618  major facilitator transporter  21.16 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  21.01 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  23.64 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  23.64 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1961  AmpG permease protein, putative  27.75 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 447 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  24.1 
 
 		 491 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5113  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 463 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0025  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 		 445 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00511907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1629  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00218526  hitchhiker  0.00000020409 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  24.1 
 
 		 493 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 517 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  24.1 
 
 		 493 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0941  hypothetical protein  26.72 
 
 		 598 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274634 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  23.27 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 459 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 517 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 456 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 517 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>