35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1426 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1426  major facilitator transporter  100 
 
 		 339 aa  634    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 439 aa  53.9  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  26.09 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 406 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  28.37 
 
 		 491 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  28.37 
 
 		 491 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  28.37 
 
 		 491 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  28.37 
 
 		 491 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  28.37 
 
 		 491 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  28.37 
 
 		 491 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  28.37 
 
 		 491 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  28.37 
 
 		 491 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  28.37 
 
 		 491 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2601  hypothetical protein  27.61 
 
 		 408 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0722822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  27.71 
 
 		 418 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  26.78 
 
 		 447 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2436  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 408 aa  47  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.649035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  25.22 
 
 		 492 aa  46.2  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  25.9 
 
 		 449 aa  46.2  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  25 
 
 		 492 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  25 
 
 		 492 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  23.27 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1437  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  28.14 
 
 		 491 aa  43.9  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  25 
 
 		 492 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2102  yersinabactin region putative transporter YbtX  28.13 
 
 		 426 aa  43.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 415 aa  43.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 444 aa  42.7  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>