33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0155 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0155  major facilitator transporter  100 
 
 
247 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238338  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  44.04 
 
 
418 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  36.61 
 
 
439 aa  99.4  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2102  yersinabactin region putative transporter YbtX  34.88 
 
 
426 aa  85.9  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 
424 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  33 
 
 
395 aa  65.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 
406 aa  63.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 
411 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  33.75 
 
 
396 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  33.75 
 
 
396 aa  58.9  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2436  major facilitator transporter  34.9 
 
 
408 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.649035  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  31.22 
 
 
413 aa  55.8  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  27.88 
 
 
271 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  30.43 
 
 
420 aa  52  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  33.54 
 
 
415 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  33.54 
 
 
415 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  33.54 
 
 
414 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  33.54 
 
 
415 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  33.17 
 
 
413 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  30.83 
 
 
417 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  36.02 
 
 
418 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
412 aa  49.7  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  29.85 
 
 
424 aa  48.9  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  32.3 
 
 
457 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.92 
 
 
423 aa  45.4  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  32.92 
 
 
423 aa  45.4  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  29.63 
 
 
465 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0886  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.92 
 
 
423 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47536  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0395  major facilitator transporter  24.22 
 
 
411 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 
447 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1437  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
415 aa  42.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  26.42 
 
 
428 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>