More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0905 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0905  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 368 aa  733    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 430 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  26.55 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  24.83 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  24.38 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  24.38 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4130  regulatory protein UhpC  24.38 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543128  normal  0.246836 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  23.97 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000215527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  23.97 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  24.66 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  23.97 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  23.97 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  24.66 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  24.66 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  23.97 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000791973  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  27.78 
 
 		 432 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1684  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.597788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  24.32 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  24.25 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  25.99 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  24 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  23.97 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  24.32 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 425 aa  67  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  25.14 
 
 		 423 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 423 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  25 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  25.99 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4119  regulatory protein UhpC  23.33 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  23 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3998  regulatory protein UhpC  23.33 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3502  regulatory protein UhpC  24.01 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4177  regulatory protein UhpC  23.33 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  21.75 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  22.19 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4069  regulatory protein UhpC  23 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  22.29 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  21.98 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  22.02 
 
 		 448 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  21.98 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  21.98 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  21.98 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  21.98 
 
 		 439 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  21.98 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.113676 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  21.98 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  24.71 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  24.09 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  24.11 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  22.74 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  21.67 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  22.9 
 
 		 430 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  22.66 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  24.56 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  23.18 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  23.11 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  21.8 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0244  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.47 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  21.59 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  24.57 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.23 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2344  regulatory protein UhpC  22.8 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.209168  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2433  regulatory protein UhpC  22.8 
 
 		 440 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.186527 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2437  regulatory protein UhpC  22.8 
 
 		 440 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2389  regulatory protein UhpC  22.8 
 
 		 440 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.365654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>