96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08080 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08080  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 398 aa  763    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0040  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 394 aa  259  8e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0235  major facilitator transporter  42.36 
 
 		 378 aa  209  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0393  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 421 aa  193  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.464327  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3879  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 		 420 aa  177  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239136  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0515  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2447  major facilitator superfamily transporter  36.26 
 
 		 397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.46629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2400  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2441  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  24.32 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  22.39 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  22.71 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  26.59 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  26.01 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  24.65 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  20.65 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4528  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  26.83 
 
 		 455 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.44 
 
 		 455 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 451 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1088  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.29 
 
 		 446 aa  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 403 aa  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.61 
 
 		 490 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02600  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.94 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  29.45 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1423  major facilitator superfamily permease  26.79 
 
 		 464 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.904673  hitchhiker  0.0000661431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 427 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2332  major facilitator transporter  22.74 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  27.1 
 
 		 415 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  27.1 
 
 		 415 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  27.1 
 
 		 415 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 		 394 aa  47.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 429 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 425 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.49 
 
 		 429 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  21.94 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  30 
 
 		 399 aa  46.6  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 219 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  27.1 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  28.68 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  28.85 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  30 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  28.68 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  28.68 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.82 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  28.68 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  28.68 
 
 		 478 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  28.68 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  28.68 
 
 		 478 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  30 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1853  major facilitator superfamily permease  25.45 
 
 		 471 aa  44.3  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  22.36 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 443 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2731  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  24.73 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 474 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  28.85 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 457 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  23.08 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 461 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4526  hypothetical protein  26.74 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.68 
 
 		 472 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  29.15 
 
 		 446 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  28.64 
 
 		 446 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  28.64 
 
 		 446 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 403 aa  43.5  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2851  protein of unknown function DUF1228  26.22 
 
 		 394 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 434 aa  43.1  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.45 
 
 		 521 aa  43.1  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 428 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>