More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0574 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  100 
 
 		 415 aa  833    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  100 
 
 		 415 aa  833    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  99.28 
 
 		 415 aa  828    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  100 
 
 		 415 aa  833    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 407 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 432 aa  202  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  27.16 
 
 		 448 aa  96.7  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 426 aa  93.2  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 428 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 436 aa  90.1  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 460 aa  90.1  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 436 aa  89.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.09 
 
 		 460 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 436 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 436 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 436 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 460 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 433 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 431 aa  86.7  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 423 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 423 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  25.14 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  24.27 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  25.33 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.5 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  26.5 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  21.66 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  25.96 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  23.9 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  25.96 
 
 		 454 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  25.96 
 
 		 454 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  23.65 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  24.73 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  24.29 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  24.74 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  24.57 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  24.74 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  24.74 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  23.58 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  23.58 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  23.58 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  25.81 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  23.58 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  22.14 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  23.58 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  24.46 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  23.58 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  23.58 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  23.58 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  24.06 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  24.53 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  22.95 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  24.27 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  22.3 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  25 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 		 458 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  21.19 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  23.22 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  26.11 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1217  d-galactonate transporter  25.19 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26743  normal  0.06903 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4063  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  21.74 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>