62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0393 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0393  major facilitator transporter  100 
 
 		 421 aa  806    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.464327  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0040  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08080  arabinose efflux permease family protein  36.91 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0235  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3879  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239136  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0515  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2447  major facilitator superfamily transporter  28.76 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.46629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2441  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2400  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  28.28 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4528  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  26.65 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  28.49 
 
 		 446 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  28.49 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 433 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 411 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 433 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 433 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 474 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 473 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 474 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 425 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 474 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  25 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  26.33 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4130  regulatory protein UhpC  25 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543128  normal  0.246836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  25 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0966  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.582345  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5295  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  26.11 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0325  sugar efflux transporter  24.14 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  30.89 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4395  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.301682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  26.88 
 
 		 455 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0241  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 393 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.616236  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3480  Arabinose efflux permease-like protein  31.45 
 
 		 738 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0787182  hitchhiker  0.00623555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 432 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 410 aa  43.1  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.22 
 
 		 455 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  29.63 
 
 		 432 aa  43.5  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  33.01 
 
 		 395 aa  43.1  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>