204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0819 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  801    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  69.36 
 
 		 416 aa  553  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  52.61 
 
 		 403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 398 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  49.49 
 
 		 402 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  45.64 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  45.74 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  45.74 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  45.74 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  45.74 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  45.74 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  45.74 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  45.74 
 
 		 393 aa  317  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  45.85 
 
 		 395 aa  316  5e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  45.48 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  43.93 
 
 		 404 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  44.17 
 
 		 396 aa  310  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  41.73 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  46.5 
 
 		 394 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  46.25 
 
 		 394 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  46.5 
 
 		 394 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  46.25 
 
 		 394 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  46.25 
 
 		 394 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 		 424 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 		 439 aa  229  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  36.98 
 
 		 426 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  35.17 
 
 		 414 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  37.11 
 
 		 426 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 413 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  37.17 
 
 		 434 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  37.01 
 
 		 426 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  37.29 
 
 		 434 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  36.36 
 
 		 409 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  35.89 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  37.37 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 		 426 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  34.26 
 
 		 426 aa  200  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  39.94 
 
 		 430 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 403 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 403 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  38.87 
 
 		 403 aa  196  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 		 430 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  38.07 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 409 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  35.14 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  38.4 
 
 		 424 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 423 aa  189  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0155  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 		 421 aa  188  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.75264  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1011  major facilitator superfamily transporter  33.16 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.355003  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  32.39 
 
 		 406 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0190  cyanate permease  35.09 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1184  hypothetical protein  32.99 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.497488  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 406 aa  176  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 		 496 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0581  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 397 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  33.85 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 402 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 361 aa  172  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  34.96 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0090  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 429 aa  169  7e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 436 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  34.75 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  29.38 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  31.7 
 
 		 404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 397 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 415 aa  162  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  34.55 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 366 aa  159  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 413 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 405 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  31.73 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  34.44 
 
 		 404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 405 aa  153  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32460  cyanate permease  31.31 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  34.14 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 437 aa  151  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0049  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>