138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3480 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3480  Arabinose efflux permease-like protein  100 
 
 		 738 aa  1375    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0787182  hitchhiker  0.00623555 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0966  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 412 aa  137  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.582345  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0964  unsaturated glucuronyl hydrolase  31.39 
 
 		 382 aa  114  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.361732  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19400  arabinose efflux permease family protein  35.67 
 
 		 407 aa  100  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  29.59 
 
 		 373 aa  95.9  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5945  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 425 aa  63.9  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3788  major facilitator superfamily MFS_1  36.94 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0393  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.464327  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  24.06 
 
 		 391 aa  59.7  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  25.68 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 402 aa  57  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0852  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 438 aa  57  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.207548 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  38.51 
 
 		 431 aa  56.2  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0303  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 402 aa  55.1  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 401 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 408 aa  54.7  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  29.53 
 
 		 461 aa  54.3  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 427 aa  54.3  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  32.7 
 
 		 401 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 439 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4278  major facilitator family transporter  30.46 
 
 		 390 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 433 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7197  major facilitator superfamily permease  27.34 
 
 		 397 aa  52.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 438 aa  52.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  28 
 
 		 438 aa  52.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 434 aa  52  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 410 aa  51.6  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 451 aa  51.6  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 417 aa  51.6  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 443 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 433 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 430 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 		 398 aa  51.2  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 433 aa  51.2  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 850 aa  50.8  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  22.09 
 
 		 400 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 426 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  22.48 
 
 		 400 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 434 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 420 aa  49.7  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 		 380 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 434 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1550  major facilitator superfamily transporter  29.56 
 
 		 426 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6216  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 		 407 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4479  major facilitator transporter  32 
 
 		 419 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  25.97 
 
 		 414 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 423 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5002  major facilitator transporter  28 
 
 		 433 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 423 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 444 aa  48.9  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 439 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 429 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  28 
 
 		 433 aa  49.3  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5135  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 422 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 425 aa  48.5  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 503 aa  48.5  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 396 aa  48.9  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 398 aa  48.5  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 403 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1996  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 485 aa  48.5  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.512683 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 439 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 396 aa  48.1  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  32.3 
 
 		 421 aa  47.8  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 432 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 429 aa  47.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  30.82 
 
 		 422 aa  47.8  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 392 aa  47.4  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 430 aa  47.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 430 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 383 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 445 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 437 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 410 aa  47.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1797  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 403 aa  47  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 428 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 419 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 403 aa  46.2  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 390 aa  46.2  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  28.62 
 
 		 440 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 427 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 405 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 472 aa  46.6  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  25.09 
 
 		 429 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  21.71 
 
 		 400 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 426 aa  46.6  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 478 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 430 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  30.21 
 
 		 433 aa  46.6  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0897  MFS drug efflux pump  26.97 
 
 		 381 aa  45.8  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 417 aa  45.8  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 447 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 430 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 422 aa  45.8  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 430 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>