61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3788 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3788  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 438 aa  803    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2414  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5945  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 		 363 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0030  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 402 aa  154  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4479  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1140  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0966  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.582345  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3480  Arabinose efflux permease-like protein  37.59 
 
 		 738 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0787182  hitchhiker  0.00623555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 380 aa  53.9  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  32.61 
 
 		 415 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  32.61 
 
 		 415 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 396 aa  53.5  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2516  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 354 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128628  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 		 394 aa  50.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  33.72 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 533 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  23.48 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19400  arabinose efflux permease family protein  30.99 
 
 		 407 aa  47.4  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 449 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 433 aa  46.6  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2104  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965781  normal  0.443718 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  26.99 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 440 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 417 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 467 aa  44.3  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2162  major facilitator transporter  21.98 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 407 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  31.8 
 
 		 460 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 443 aa  43.9  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  34.65 
 
 		 422 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.53 
 
 		 646 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.53 
 
 		 646 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.53 
 
 		 646 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 439 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  25.77 
 
 		 410 aa  43.1  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  31.1 
 
 		 198 aa  43.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>