53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4479 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4479  major facilitator transporter  100 
 
 		 419 aa  781    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2414  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5945  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0030  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 402 aa  122  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3788  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 438 aa  112  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1140  major facilitator superfamily MFS_1  33.22 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0966  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.582345  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 429 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 433 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2162  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 451 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 433 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3480  Arabinose efflux permease-like protein  31.79 
 
 		 738 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0787182  hitchhiker  0.00623555 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  26.5 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 394 aa  47.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 425 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0852  major facilitator superfamily MFS_1  21.48 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.207548 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  27.45 
 
 		 465 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 421 aa  43.5  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 474 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 425 aa  43.5  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  31.76 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 402 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  31.76 
 
 		 458 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 439 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  35 
 
 		 412 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  31.76 
 
 		 446 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  31.18 
 
 		 446 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  31.76 
 
 		 446 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1780  major facilitator transporter  25 
 
 		 379 aa  43.1  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 474 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3474  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 415 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00256717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>