More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1885 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  100 
 
 
402 aa  781    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  45.96 
 
 
420 aa  329  6e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  47.47 
 
 
422 aa  311  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  48.78 
 
 
440 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  47.79 
 
 
420 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  42.89 
 
 
411 aa  293  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  43.7 
 
 
411 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 
417 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  46.32 
 
 
422 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  43.22 
 
 
420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  46.7 
 
 
417 aa  277  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  46.86 
 
 
421 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  46.12 
 
 
423 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  46.12 
 
 
415 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  42.08 
 
 
414 aa  226  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 
394 aa  189  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
396 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 
396 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 
394 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  33.58 
 
 
407 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  36.46 
 
 
403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  33.33 
 
 
405 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 
419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  32.99 
 
 
405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
418 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
449 aa  90.1  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  27.76 
 
 
406 aa  88.2  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  27.79 
 
 
410 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
390 aa  86.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  29.29 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  29.29 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  29.29 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  29.29 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  28.96 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  29.29 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  29.29 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  27.34 
 
 
404 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  27.34 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  27.34 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  27.99 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  27.99 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  26.97 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  28.21 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  26.48 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  27.99 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  29.59 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  29.63 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  29.63 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  27.99 
 
 
421 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  29.63 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  29.63 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  27.02 
 
 
403 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  29.63 
 
 
406 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  27.3 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  26.78 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  27.5 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  30.91 
 
 
429 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  26.09 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  28.62 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  26.4 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  29.05 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  27.46 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  28.92 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  25.78 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  27.07 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  26.09 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  26.09 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  26.09 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  26.09 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  26.4 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  28.57 
 
 
416 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  28.57 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  28.57 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  27.07 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  28.57 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  27.07 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  28.57 
 
 
416 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  27.02 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  26.05 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  27.41 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  27.05 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  25.08 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  27.99 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  31.61 
 
 
422 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  24.57 
 
 
403 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  27.99 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  28.82 
 
 
421 aa  71.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  28.23 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>