65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_19400 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_19400  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 
407 aa  763    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0966  major facilitator transporter  32.99 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.582345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3480  Arabinose efflux permease-like protein  37.72 
 
 
738 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0787182  hitchhiker  0.00623555 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5945  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 
434 aa  56.6  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  27.8 
 
 
425 aa  56.6  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
429 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3788  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
438 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
391 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
219 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 
426 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  23.82 
 
 
446 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  24.75 
 
 
429 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  23.96 
 
 
455 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  27.82 
 
 
429 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
442 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3034  major facilitator transporter  24.39 
 
 
432 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.201695  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  22.87 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  22.87 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  25 
 
 
893 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  28.39 
 
 
405 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
450 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  23.42 
 
 
381 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  28.95 
 
 
422 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
380 aa  47.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  25.85 
 
 
430 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  25.56 
 
 
402 aa  47  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.59 
 
 
381 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  26.09 
 
 
430 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  26.61 
 
 
431 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  26.09 
 
 
445 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  26.09 
 
 
430 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  26.09 
 
 
445 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  26.25 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  26.09 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  24.91 
 
 
442 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  27.92 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  24.45 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  26.09 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  26.09 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
449 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
421 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  23.14 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.42 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0999  major facilitator transporter  27.34 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.77003  normal  0.0952773 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0320  transporter, major facilitator family protein  30.88 
 
 
474 aa  45.1  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  27.15 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
431 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0010  d-galactonate transporter  28.23 
 
 
430 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.661181  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.04 
 
 
381 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  21.23 
 
 
432 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0325  sugar efflux transporter  23.72 
 
 
403 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.14 
 
 
381 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  23.17 
 
 
428 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.06 
 
 
433 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  27.45 
 
 
420 aa  43.9  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
429 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  29.3 
 
 
411 aa  43.5  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  43.55 
 
 
407 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
407 aa  43.1  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  23.85 
 
 
450 aa  43.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 
441 aa  42.7  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>