More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0325 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0325  sugar efflux transporter  100 
 
 		 403 aa  803    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1277  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 410 aa  296  5e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1077  major facilitator transporter  37.69 
 
 		 403 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1550  major facilitator superfamily transporter  33.76 
 
 		 426 aa  249  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5135  major facilitator transporter  36.58 
 
 		 422 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1090  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 419 aa  239  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3965  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.748751  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 		 439 aa  223  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  34.69 
 
 		 421 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3453  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 		 420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.0945543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5307  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 424 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.535267  normal  0.123974 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2452  hypothetical protein  26.61 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21230  catecholate siderophore efflux pump, MFS_1 family  29.43 
 
 		 407 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000768503  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4255  Arabinose efflux permease-like protein  36.42 
 
 		 217 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  26.45 
 
 		 398 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  27.82 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2559  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  26.67 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  26.67 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0461  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2117  putative multidrug resistance protein  26.37 
 
 		 391 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.521892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1862  multidrug resistance protein  25.85 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1832  multidrug resistance protein  25.71 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2004  multidrug resistance protein  25.85 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627866  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2038  putative multidrug resistance protein  25.71 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3423e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1816  permease; multidrug resistance protein  25.59 
 
 		 391 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 408 aa  93.6  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2006  putative multidrug resistance protein  25.81 
 
 		 391 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3303  putative multidrug resistance protein  26.88 
 
 		 391 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0914  MFS transporter  27.85 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1672  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000335684  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  24.44 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  24.74 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  22.85 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  24.39 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2479  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000498746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2528  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00311461  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 317 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  25.19 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  19.22 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2232  major facilitator superfamily protein  23.36 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.165847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  23.1 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  21.51 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  25.25 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  25 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0384  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  23.05 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  23.05 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2036  major facilitator superfamily protein  23.72 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.539709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  23.05 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  23.05 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  23.05 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  23.05 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  23.05 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  23.48 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1256  transporter, putative  21.26 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  23.3 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  22.63 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1377  transporter, putative  21.26 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  23.3 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4500  major facilitator superfamily transporter  23.87 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  25 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  26.92 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0286  major facilitator superfamily transporter  24.43 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0490  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.928419  normal  0.73631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>