More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4255 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4255  Arabinose efflux permease-like protein  100 
 
 		 217 aa  434  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3965  major facilitator transporter  73.62 
 
 		 413 aa  249  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.748751  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5307  major facilitator superfamily MFS_1  68.97 
 
 		 424 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.535267  normal  0.123974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  58.42 
 
 		 419 aa  227  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3453  major facilitator superfamily MFS_1  68.1 
 
 		 420 aa  221  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.0945543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1550  major facilitator superfamily transporter  45.68 
 
 		 426 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1077  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 403 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1277  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 410 aa  134  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5135  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 422 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 		 439 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 439 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1090  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 418 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  41.46 
 
 		 421 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0325  sugar efflux transporter  36.42 
 
 		 403 aa  122  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21230  catecholate siderophore efflux pump, MFS_1 family  37.82 
 
 		 407 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000768503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2452  hypothetical protein  35.9 
 
 		 408 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  32.05 
 
 		 398 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  31.17 
 
 		 421 aa  82  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.77 
 
 		 565 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  27.13 
 
 		 526 aa  80.1  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.3 
 
 		 509 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  31.31 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  31.4 
 
 		 390 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  31.4 
 
 		 390 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  31.4 
 
 		 390 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  31.4 
 
 		 390 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0914  MFS transporter  29.94 
 
 		 395 aa  78.2  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  32.05 
 
 		 398 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  31.4 
 
 		 390 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  32.05 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  32.05 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  26.6 
 
 		 526 aa  77.4  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 513 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.16 
 
 		 512 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 389 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 513 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  30.3 
 
 		 388 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 389 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 		 493 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  27.78 
 
 		 467 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 487 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 414 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  30.3 
 
 		 388 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.39 
 
 		 512 aa  75.1  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  25.47 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  32.35 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.37 
 
 		 520 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0461  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.37 
 
 		 520 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  25.47 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  25.47 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  31.41 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.95 
 
 		 514 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  30.77 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  25.47 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  30.77 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.56 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0958  major facilitator superfamily transporter  32.26 
 
 		 399 aa  72.4  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.596734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  29.37 
 
 		 534 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 516 aa  72.4  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 389 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.57 
 
 		 514 aa  72.4  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 388 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  28.39 
 
 		 387 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 539 aa  72  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 243 aa  72  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 509 aa  72  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 512 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 408 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 512 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>