More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1090 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1090  major facilitator transporter  100 
 
 		 418 aa  818    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5135  major facilitator transporter  78.5 
 
 		 422 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  69.4 
 
 		 439 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  69.65 
 
 		 439 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  69.33 
 
 		 421 aa  521  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1277  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 410 aa  288  9e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1077  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 403 aa  279  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1550  major facilitator superfamily transporter  38.86 
 
 		 426 aa  268  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0325  sugar efflux transporter  37.66 
 
 		 403 aa  259  6e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3965  major facilitator transporter  35.09 
 
 		 413 aa  242  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.748751  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 419 aa  226  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5307  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 		 424 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.535267  normal  0.123974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3453  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 420 aa  203  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.0945543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21230  catecholate siderophore efflux pump, MFS_1 family  35.61 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000768503  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4255  Arabinose efflux permease-like protein  40.85 
 
 		 217 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0461  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2452  hypothetical protein  27.11 
 
 		 408 aa  129  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2559  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 400 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  26.84 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  23.61 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  26.98 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 391 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 391 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 403 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 409 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.19 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.19 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  29.14 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  26.35 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2232  major facilitator superfamily protein  22.52 
 
 		 379 aa  90.9  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.165847  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 389 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  28 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 412 aa  90.5  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  23.37 
 
 		 400 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 406 aa  90.1  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.17 
 
 		 411 aa  90.1  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  28 
 
 		 400 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  23.37 
 
 		 398 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0451  putative MFS transporter  29.97 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.892159 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  27.12 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  26.84 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  24.6 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  26.84 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  24.6 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  24.6 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  26.84 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  26.84 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  24.6 
 
 		 404 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 404 aa  87  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 389 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  23.61 
 
 		 398 aa  86.3  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  27.37 
 
 		 399 aa  86.7  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 390 aa  86.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 392 aa  86.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 389 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.38 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  27.31 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  25 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  25.19 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  26.35 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  26.51 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1672  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000335684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  26.51 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  26.33 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.89 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  26.84 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  23.87 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  28.32 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  31.84 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  23.87 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  23.87 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  24.44 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>