More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2559 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2559  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 400 aa  759    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0325  sugar efflux transporter  28.99 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 439 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 439 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1550  major facilitator superfamily transporter  30.3 
 
 		 426 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  29.05 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1832  multidrug resistance protein  27.32 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2038  putative multidrug resistance protein  27.32 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3423e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  27.27 
 
 		 398 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1862  multidrug resistance protein  27.32 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2004  multidrug resistance protein  27.32 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627866  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1090  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  29.04 
 
 		 400 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  27.27 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2117  putative multidrug resistance protein  27.15 
 
 		 391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.521892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  28.09 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1277  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 410 aa  109  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5135  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1816  permease; multidrug resistance protein  26.74 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2006  putative multidrug resistance protein  26.33 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 403 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3303  putative multidrug resistance protein  27.55 
 
 		 391 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1077  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  33.22 
 
 		 384 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3965  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.748751  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 419 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 391 aa  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5307  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.535267  normal  0.123974 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1348  arabinose efflux permease  25.54 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0715454  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 432 aa  86.7  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  31.11 
 
 		 458 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3453  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.0945543 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  28.13 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4422  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  28.13 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  25.24 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  28.13 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2270  major facilitator superfamily protein  23.23 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  25.88 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2452  hypothetical protein  25.98 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  25.42 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4082  General substrate transporter  30.35 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  24.23 
 
 		 500 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.62 
 
 		 524 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  30.88 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  28.07 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  28.67 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  28.83 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4117  putative permease  23.53 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0461  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0128  major facilitator superfamily protein  31.85 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  26.1 
 
 		 399 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4224  putative permease  23.53 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4044  putative permease  23.2 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1377  transporter, putative  23.53 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6639  general substrate transporter  29.07 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1753  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.945556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>