281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3973 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
449 aa  879    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
396 aa  100  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
396 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 
418 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  26.75 
 
 
411 aa  90.1  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  26.92 
 
 
403 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 
427 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  26.13 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  25.6 
 
 
403 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  25.19 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
434 aa  73.2  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  25.38 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  27.3 
 
 
440 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 
449 aa  70.5  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  25.06 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  23.9 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  23.9 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  23.9 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  23.9 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  23.9 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
400 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  23.9 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  23.9 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 
449 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  25.45 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
394 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 
417 aa  65.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  23.96 
 
 
427 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  28.81 
 
 
439 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  22.27 
 
 
452 aa  63.9  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  28.81 
 
 
439 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  25.13 
 
 
407 aa  63.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 
428 aa  63.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25.49 
 
 
439 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  27.05 
 
 
422 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
399 aa  62.4  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  25.7 
 
 
422 aa  62.4  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  23.95 
 
 
440 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  28.25 
 
 
439 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 
413 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
433 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  25.63 
 
 
402 aa  60.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
451 aa  60.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0290  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
420 aa  60.1  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.338306  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  22.56 
 
 
423 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  23.68 
 
 
437 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  24.15 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  24.15 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 
409 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  24.17 
 
 
443 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  23.45 
 
 
403 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
416 aa  57.4  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  21.01 
 
 
453 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  24.3 
 
 
405 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  22.64 
 
 
435 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 
453 aa  56.6  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  25.08 
 
 
893 aa  56.6  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 
415 aa  56.6  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 
413 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
420 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 
440 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 
410 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2594  major facilitator transporter  24.22 
 
 
395 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2055  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 
427 aa  55.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  27.37 
 
 
472 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  25.16 
 
 
439 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  25.16 
 
 
439 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  34.69 
 
 
412 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5584  major facilitator transporter  24.29 
 
 
406 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0185  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
401 aa  54.3  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.73097 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5948  major facilitator transporter  24.29 
 
 
406 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  23.84 
 
 
428 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  22.63 
 
 
449 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.67 
 
 
437 aa  54.3  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  22.28 
 
 
429 aa  53.9  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 
437 aa  53.9  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  23.38 
 
 
428 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
437 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  22.42 
 
 
432 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  22.42 
 
 
432 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  26.5 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  22.38 
 
 
449 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  20.68 
 
 
415 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6449  major facilitator transporter  25.53 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  22.98 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
403 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  22.42 
 
 
432 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  22.63 
 
 
449 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  20.44 
 
 
415 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  20.44 
 
 
415 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  25.95 
 
 
450 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>