68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0290 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0290  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
420 aa  799    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.338306  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  67.54 
 
 
420 aa  533  1e-150  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  64.04 
 
 
440 aa  511  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  51.62 
 
 
423 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  53.17 
 
 
427 aa  373  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  48.82 
 
 
423 aa  349  6e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  47.28 
 
 
399 aa  323  3e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  45.83 
 
 
428 aa  318  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  30.02 
 
 
429 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1181  MFS family transporter  26.93 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13070  MFS family transporter  26.2 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
449 aa  77.4  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  31.68 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  32.08 
 
 
422 aa  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  28.61 
 
 
398 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
390 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 
418 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
398 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  34.56 
 
 
402 aa  60.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  29.27 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 
396 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6287  major facilitator superfamily permease  29.28 
 
 
397 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  23.91 
 
 
403 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  31.25 
 
 
440 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  25.56 
 
 
403 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  25 
 
 
383 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 
417 aa  53.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  29.57 
 
 
422 aa  53.1  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4228  hypothetical protein  37.16 
 
 
443 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.06951 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  25.81 
 
 
411 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  29.89 
 
 
421 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  31.28 
 
 
420 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  30.28 
 
 
403 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 
400 aa  49.7  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1472  major facilitator transporter  26.57 
 
 
458 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302932  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  34.04 
 
 
400 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  25.23 
 
 
422 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  25.97 
 
 
382 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 
390 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  33.33 
 
 
468 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
419 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  31.58 
 
 
405 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
394 aa  47  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  28.24 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  28.83 
 
 
417 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 
390 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  28.66 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.38 
 
 
452 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 
463 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  26.39 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8658  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
434 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0185  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
401 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.73097 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  32.38 
 
 
468 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  32.38 
 
 
468 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 
388 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 
435 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 
435 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.95 
 
 
500 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  32.38 
 
 
397 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  24.69 
 
 
432 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 
408 aa  43.1  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0033  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 
409 aa  43.1  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  29.56 
 
 
423 aa  43.1  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
395 aa  43.1  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2144  major facilitator transporter  28.9 
 
 
400 aa  43.1  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>