More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0613 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 422 aa  809    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  73.65 
 
 		 420 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  69.14 
 
 		 422 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  72.13 
 
 		 423 aa  502  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  70.53 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  72.24 
 
 		 415 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  63.05 
 
 		 421 aa  428  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  50.49 
 
 		 420 aa  362  6e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  50.25 
 
 		 440 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  44.81 
 
 		 411 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  44.56 
 
 		 411 aa  307  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  43.98 
 
 		 420 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  43.52 
 
 		 417 aa  293  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  46.65 
 
 		 402 aa  268  8.999999999999999e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 394 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 414 aa  182  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 396 aa  170  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 403 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 396 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 419 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  31.75 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  27.07 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  29.43 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  26.84 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  26.43 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  25.72 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  26.43 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  26.43 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  28.68 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  26.13 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  24.19 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  26.17 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  26.17 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  26.2 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 422 aa  67  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  25.12 
 
 		 420 aa  67  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  24.86 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0290  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  26.67 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  26.67 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  26.67 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  26.67 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1603  major facilitator superfamily MFS_1  22.78 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  24.76 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  26.67 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  24.43 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  24.76 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  24.43 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  24.76 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  24.76 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>