More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0689 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 407 aa  784    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  64.11 
 
 		 403 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  51.17 
 
 		 394 aa  335  5.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  49.48 
 
 		 394 aa  326  5e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  50.26 
 
 		 396 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  50.26 
 
 		 396 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  47.16 
 
 		 405 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  47.16 
 
 		 419 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  47.95 
 
 		 405 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 414 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  35.87 
 
 		 411 aa  179  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 417 aa  173  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  33.83 
 
 		 422 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  33.5 
 
 		 422 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  35.21 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 449 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 418 aa  97.1  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 429 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 403 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  26.3 
 
 		 401 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 402 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  27.4 
 
 		 421 aa  86.3  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.04 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.09 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  24.83 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  26.54 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 447 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 447 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  24.21 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  24.22 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  25 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  24.5 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  24.92 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  24.5 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  24.5 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  23.89 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  23.89 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  23.89 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  23.89 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  25.1 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  25 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  24.1 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  25.91 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  25.91 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0053  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  25.91 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2007  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28785 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  25.91 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>