More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2437 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
396 aa  772    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  62.63 
 
 
382 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1844  major facilitator transporter  46.67 
 
 
389 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 
395 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 
406 aa  227  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  35.22 
 
 
401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  32.89 
 
 
393 aa  179  8e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
401 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 
388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  32.64 
 
 
390 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
408 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  32.28 
 
 
386 aa  144  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
410 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  28.92 
 
 
403 aa  142  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  29.33 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  30.85 
 
 
410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  32.53 
 
 
391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  28.57 
 
 
403 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  30.46 
 
 
415 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 
382 aa  136  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 
393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  31.31 
 
 
403 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
404 aa  133  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  31.11 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  31.88 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  31.18 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  31.72 
 
 
403 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  31.72 
 
 
403 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  31.72 
 
 
403 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  31.72 
 
 
403 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  30.63 
 
 
403 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  31.06 
 
 
403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  31.49 
 
 
403 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 
402 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  30.87 
 
 
404 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  31.05 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  28.53 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  29.87 
 
 
410 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
417 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  30.29 
 
 
420 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  29.71 
 
 
420 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  30.57 
 
 
403 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  28.73 
 
 
417 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  28.73 
 
 
417 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  28.73 
 
 
416 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  28.73 
 
 
417 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  31.53 
 
 
412 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  29.05 
 
 
416 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  28.73 
 
 
416 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  29.05 
 
 
416 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 
408 aa  123  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  29.51 
 
 
422 aa  123  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  29.2 
 
 
421 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2819  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401462  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  31.54 
 
 
388 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  26.79 
 
 
421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0137  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0222229  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  29.51 
 
 
431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  30.93 
 
 
406 aa  119  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  27.9 
 
 
401 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 
398 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 
399 aa  119  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  29.95 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  29.24 
 
 
421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  30.29 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3923  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
418 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  30.58 
 
 
412 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  28.05 
 
 
397 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  29.13 
 
 
420 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  27.7 
 
 
398 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  29.95 
 
 
403 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
403 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  29.46 
 
 
404 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  30.03 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  29.17 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  30.97 
 
 
406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  30.97 
 
 
406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0282  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 
421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  30.61 
 
 
406 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  29.86 
 
 
406 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
410 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  30.87 
 
 
409 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  31.07 
 
 
403 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  29.46 
 
 
404 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  30.61 
 
 
406 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
410 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
406 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  29.55 
 
 
412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  30.97 
 
 
406 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  30.97 
 
 
406 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  30.45 
 
 
413 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4797  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 
421 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.292232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  28.05 
 
 
404 aa  112  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  28.21 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  30.36 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  29.69 
 
 
412 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>