More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1946 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  100 
 
 		 420 aa  822    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  52.75 
 
 		 422 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  47.46 
 
 		 420 aa  343  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  48.24 
 
 		 440 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  51.46 
 
 		 423 aa  333  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  45.68 
 
 		 411 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  50.49 
 
 		 422 aa  325  7e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  50.66 
 
 		 417 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  49.75 
 
 		 420 aa  322  7e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  48.65 
 
 		 421 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 411 aa  311  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 		 417 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  50.5 
 
 		 415 aa  301  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  45.96 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 394 aa  199  7.999999999999999e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 414 aa  199  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 394 aa  196  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 396 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  34.53 
 
 		 407 aa  156  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 419 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 405 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 		 418 aa  93.6  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  27.06 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  24.01 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  24.01 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  24.01 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  24.01 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  22.41 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  24.07 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  27.5 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0290  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  25 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  24.11 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  22.9 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  26.84 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.19 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  22.01 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  26.14 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.56 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  22.58 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254486  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  26 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 433 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 404 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  25.32 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  24.17 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  26.44 
 
 		 446 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>