More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5948 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  86.85 
 
 		 403 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6449  major facilitator transporter  97.54 
 
 		 406 aa  714    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  87.34 
 
 		 403 aa  672    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5584  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  789    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5948  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  789    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  87.43 
 
 		 383 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0185  major facilitator superfamily MFS_1  64.49 
 
 		 401 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.73097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1427  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 445 aa  341  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.08987  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4416  major facilitator transporter  56.19 
 
 		 408 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2104  major facilitator superfamily MFS_1  53.28 
 
 		 404 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965781  normal  0.443718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2144  major facilitator transporter  51.97 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2421  major facilitator superfamily MFS_1  50.75 
 
 		 400 aa  276  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.107516 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  26 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  26 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  31.4 
 
 		 448 aa  67  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  25 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  21.98 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  21.78 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  23.25 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 413 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0419  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 396 aa  57  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.42011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  22.73 
 
 		 443 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  27.11 
 
 		 449 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  24.01 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  22.73 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 429 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  25 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  25.4 
 
 		 420 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 467 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  25.13 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  24.38 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  24.14 
 
 		 431 aa  54.3  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  24.38 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  24.38 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 432 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 420 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  24.38 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  24.38 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 401 aa  53.5  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  20.82 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 421 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 417 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 406 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 410 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 429 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.8 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 440 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  30.37 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>