More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3837 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
400 aa  774    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  51.4 
 
 
407 aa  391  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  53.05 
 
 
434 aa  370  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  51.44 
 
 
394 aa  354  2e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2430  major facilitator superfamily MFS_1  47.81 
 
 
398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3635  major facilitator superfamily MFS_1  39.37 
 
 
441 aa  262  8.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 
390 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 
414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 
394 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 
409 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
390 aa  94  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 
412 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1616  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
406 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  26.49 
 
 
417 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  25.92 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  26.79 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  26.05 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  26.79 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  26.79 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  27.37 
 
 
434 aa  73.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  25.32 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  27.66 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
432 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 
430 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  24.93 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1899  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 
407 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
449 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  24.81 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  27.17 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0319  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 
409 aa  66.2  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
418 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  27.89 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 
461 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  24.14 
 
 
403 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  27.04 
 
 
429 aa  64.3  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  24.94 
 
 
448 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  28.61 
 
 
433 aa  63.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
435 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  27.07 
 
 
436 aa  63.5  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  27.5 
 
 
429 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  27.2 
 
 
421 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
434 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  25.47 
 
 
435 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  24.8 
 
 
432 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  31.29 
 
 
450 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 
428 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  27.84 
 
 
427 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  25.5 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  23.69 
 
 
428 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  30.34 
 
 
437 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 
411 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  25.93 
 
 
423 aa  60.5  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
429 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  26.09 
 
 
432 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
437 aa  59.7  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  23.89 
 
 
456 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  25.74 
 
 
434 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  23.43 
 
 
383 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  26.09 
 
 
432 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  26.61 
 
 
409 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  23.81 
 
 
429 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  31.9 
 
 
422 aa  59.3  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  23.84 
 
 
463 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  26.41 
 
 
430 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  30.21 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  23.73 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1534  major facilitator transporter  24.03 
 
 
414 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861998  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  30.21 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  25.8 
 
 
432 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 
423 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
441 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  24.93 
 
 
432 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
415 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  25.47 
 
 
434 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
415 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  34.64 
 
 
440 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  22.81 
 
 
429 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  24.8 
 
 
441 aa  56.2  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  26.71 
 
 
436 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  25.41 
 
 
437 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  25.93 
 
 
479 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
430 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 
446 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  26.21 
 
 
430 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
449 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  25.69 
 
 
426 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
449 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  22.78 
 
 
450 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  32.24 
 
 
484 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  24.19 
 
 
432 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>