More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1459 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 411 aa  801    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  60.76 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  59 
 
 		 426 aa  421  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4261  major facilitator transporter  60.89 
 
 		 416 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.861934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  42.69 
 
 		 462 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1601  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 488 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 466 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1318  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  52.33 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  48 
 
 		 476 aa  170  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2004  major facilitator superfamily MFS_1  51.11 
 
 		 476 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0685608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  46.15 
 
 		 510 aa  167  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  45.31 
 
 		 503 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.59 
 
 		 500 aa  153  7e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2367  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 464 aa  141  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.94 
 
 		 483 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.69 
 
 		 478 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.6 
 
 		 534 aa  133  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  28.75 
 
 		 457 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  28.75 
 
 		 457 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  28.5 
 
 		 457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  28.5 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40 
 
 		 458 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.22 
 
 		 540 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 480 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 459 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 488 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 462 aa  123  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.29 
 
 		 456 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.95 
 
 		 474 aa  123  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.44 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.71 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.44 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.44 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.99 
 
 		 475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.18 
 
 		 485 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.78 
 
 		 546 aa  121  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.06 
 
 		 486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.06 
 
 		 486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.06 
 
 		 486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 459 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1157  major facilitator family transporter  37.35 
 
 		 459 aa  119  9e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.49 
 
 		 493 aa  119  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4168  major facilitator transporter  37.13 
 
 		 474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.55276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.33 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.69 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.33 
 
 		 484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.33 
 
 		 478 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.88 
 
 		 519 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.43 
 
 		 457 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.16 
 
 		 482 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.82 
 
 		 532 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  27.55 
 
 		 473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.91 
 
 		 496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.79 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.16 
 
 		 482 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.8 
 
 		 508 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.43 
 
 		 510 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.68 
 
 		 510 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.37 
 
 		 495 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  37.78 
 
 		 480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.75 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.04 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.63 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.57 
 
 		 512 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 466 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.13 
 
 		 483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.66 
 
 		 483 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.61 
 
 		 478 aa  110  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.66 
 
 		 461 aa  110  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3040  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 469 aa  110  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.071182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 480 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4129  MFS family transporter  37.22 
 
 		 480 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 		 488 aa  109  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.37 
 
 		 480 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.34 
 
 		 545 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.55 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1663  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.742042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>