More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0381 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  100 
 
 		 414 aa  781    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  60.76 
 
 		 411 aa  448  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  62.96 
 
 		 426 aa  430  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4261  major facilitator transporter  59.84 
 
 		 416 aa  362  7.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.861934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  46.84 
 
 		 466 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1318  major facilitator superfamily MFS_1  44.34 
 
 		 474 aa  276  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 462 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  58.79 
 
 		 476 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1601  major facilitator transporter  56.25 
 
 		 488 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  57.23 
 
 		 503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  56.73 
 
 		 510 aa  180  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  57.83 
 
 		 491 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 		 483 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2004  major facilitator superfamily MFS_1  54.91 
 
 		 476 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0685608 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2367  major facilitator transporter  51.67 
 
 		 478 aa  166  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.62 
 
 		 475 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.31 
 
 		 474 aa  156  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.42 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  30.19 
 
 		 457 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  30.19 
 
 		 457 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 457 aa  150  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  29.95 
 
 		 457 aa  150  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 457 aa  150  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  29.95 
 
 		 457 aa  150  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 457 aa  150  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 457 aa  150  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.91 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 488 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 457 aa  147  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 416 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 480 aa  144  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.43 
 
 		 478 aa  143  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 459 aa  143  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.07 
 
 		 457 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.83 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.83 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.83 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.83 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  29.59 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.05 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 		 482 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.74 
 
 		 474 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 475 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  29.4 
 
 		 473 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 		 459 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.24 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 459 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.97 
 
 		 465 aa  133  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 455 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.22 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1140  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.62 
 
 		 477 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  39.79 
 
 		 504 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.79 
 
 		 498 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.66 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 472 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.62 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.04 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.51 
 
 		 509 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  26.77 
 
 		 458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  30 
 
 		 464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.1 
 
 		 540 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 498 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3366  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 474 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.49 
 
 		 488 aa  119  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1455  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.57 
 
 		 521 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1015  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 498 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.817522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.79 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.93 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.31 
 
 		 505 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.33 
 
 		 483 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4168  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 474 aa  117  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.55276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3110  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 469 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 480 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.31 
 
 		 510 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.23 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.76 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  39.46 
 
 		 501 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5842  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.1 
 
 		 485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  37.37 
 
 		 515 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.46 
 
 		 502 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>