More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1408 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  100 
 
 
484 aa  968    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3410  major facilitator superfamily MFS_1  60.38 
 
 
484 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5143  major facilitator transporter  56.75 
 
 
482 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 
451 aa  183  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.26 
 
 
461 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  30.55 
 
 
474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 
470 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.63 
 
 
472 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
459 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 
472 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  30.58 
 
 
473 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
451 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 
456 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  30.36 
 
 
474 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  30.18 
 
 
474 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.51 
 
 
455 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  29 
 
 
457 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  30.21 
 
 
435 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.02 
 
 
462 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  29.96 
 
 
474 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  31.02 
 
 
432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  31.02 
 
 
432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  28.76 
 
 
464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  31.02 
 
 
432 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  29.5 
 
 
459 aa  153  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  29.81 
 
 
432 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.29 
 
 
455 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  30.53 
 
 
467 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.74 
 
 
468 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  27.54 
 
 
456 aa  152  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  30.54 
 
 
434 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  30.3 
 
 
434 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
451 aa  150  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 
477 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.29 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  30.06 
 
 
476 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  29.29 
 
 
477 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  30.26 
 
 
473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  28.51 
 
 
478 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 
473 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  28.72 
 
 
463 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  26.3 
 
 
472 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  26.3 
 
 
472 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  28.51 
 
 
478 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  26.3 
 
 
472 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  28.51 
 
 
478 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  28.51 
 
 
478 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  28.51 
 
 
478 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  28.29 
 
 
478 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  28.29 
 
 
478 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  27.18 
 
 
472 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  26.97 
 
 
492 aa  143  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.66 
 
 
447 aa  143  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.2 
 
 
474 aa  143  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  27.79 
 
 
452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  26.77 
 
 
475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  26.77 
 
 
475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  26.22 
 
 
472 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  27.83 
 
 
462 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  28.22 
 
 
472 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  28.22 
 
 
472 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  28.22 
 
 
472 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 
447 aa  140  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
452 aa  140  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  27.57 
 
 
452 aa  140  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
466 aa  140  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  28 
 
 
472 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 
460 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  27.75 
 
 
472 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  27.67 
 
 
472 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 
471 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  25.83 
 
 
480 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  29.83 
 
 
416 aa  139  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  28.46 
 
 
471 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  25.83 
 
 
480 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  27.78 
 
 
438 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  26.23 
 
 
480 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  26.23 
 
 
480 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  25.83 
 
 
480 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  27.57 
 
 
452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  27.57 
 
 
452 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  27.57 
 
 
452 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  27.57 
 
 
452 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  27.61 
 
 
462 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.4 
 
 
460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 
488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  28.79 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  29.05 
 
 
430 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
473 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.31 
 
 
487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.9 
 
 
468 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 
435 aa  133  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
461 aa  133  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 
430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  28.57 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.95 
 
 
462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  27.59 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.36 
 
 
450 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>