More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0319 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0319  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
409 aa  761    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  57.04 
 
 
409 aa  430  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1616  major facilitator superfamily MFS_1  61.79 
 
 
406 aa  387  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  57.72 
 
 
412 aa  372  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 
434 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 
400 aa  107  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 
390 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
394 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 
394 aa  100  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
391 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
407 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3635  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 
441 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2430  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 
432 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 
449 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  34.57 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  27.99 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1899  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  32.15 
 
 
432 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 
417 aa  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  25.49 
 
 
434 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  35.08 
 
 
411 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  25.71 
 
 
425 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  27.39 
 
 
423 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  27.39 
 
 
423 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  24.53 
 
 
439 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  27.05 
 
 
434 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
386 aa  60.5  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 
407 aa  60.1  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
427 aa  60.1  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  23.82 
 
 
415 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  27.13 
 
 
420 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  24.71 
 
 
436 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  23.58 
 
 
415 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  26.86 
 
 
420 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  23.58 
 
 
415 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  23.58 
 
 
415 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  28.22 
 
 
428 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  26.4 
 
 
417 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.98 
 
 
397 aa  57.4  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  28.66 
 
 
442 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  28.53 
 
 
420 aa  56.2  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  28.66 
 
 
442 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4906  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
440 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.291929  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  26.6 
 
 
420 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  27.3 
 
 
399 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  26.6 
 
 
420 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  27.53 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  26.6 
 
 
420 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  24.48 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  33.78 
 
 
410 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  27.6 
 
 
426 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  26.55 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  33.73 
 
 
442 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  24.36 
 
 
429 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
409 aa  54.3  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
394 aa  54.3  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 
396 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  24.16 
 
 
390 aa  53.9  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
415 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  27.62 
 
 
457 aa  53.5  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
415 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  26.02 
 
 
430 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  26.08 
 
 
411 aa  53.5  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.08 
 
 
485 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  25.93 
 
 
434 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
421 aa  53.1  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  26.29 
 
 
428 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  25.11 
 
 
450 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  28.05 
 
 
429 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
416 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  27.13 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  25.2 
 
 
434 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1455  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
394 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  25.82 
 
 
430 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  25.82 
 
 
430 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  29.28 
 
 
434 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  27.27 
 
 
439 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 
413 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  25.82 
 
 
445 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0033  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 
409 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  26.33 
 
 
430 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  27.2 
 
 
431 aa  52.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.24 
 
 
440 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  25.82 
 
 
430 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.73 
 
 
478 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  25.82 
 
 
445 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>