More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1616 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1616  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
406 aa  757    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  69.21 
 
 
409 aa  517  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0319  major facilitator superfamily MFS_1  60.79 
 
 
409 aa  404  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  58.72 
 
 
412 aa  380  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 
391 aa  127  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 
434 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
390 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 
390 aa  110  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
394 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
394 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 
400 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 
407 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
390 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 
390 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 
400 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
414 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
390 aa  99  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3635  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
441 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1899  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
387 aa  89.7  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 
432 aa  86.7  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2430  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  28.01 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  28.57 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 
449 aa  66.6  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  25.98 
 
 
423 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  25.98 
 
 
423 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  26.47 
 
 
448 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  27.11 
 
 
427 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.46 
 
 
430 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 
395 aa  62.4  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1455  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
394 aa  61.6  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  28.32 
 
 
410 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
430 aa  61.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  28.82 
 
 
432 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  28.22 
 
 
434 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
415 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  27.19 
 
 
423 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  29.61 
 
 
432 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  28.89 
 
 
434 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  27.54 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  28.57 
 
 
432 aa  58.9  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  28.53 
 
 
432 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  27.46 
 
 
429 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  26.97 
 
 
396 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  28.85 
 
 
425 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  26.92 
 
 
500 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  25.69 
 
 
429 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  28.24 
 
 
432 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  29.92 
 
 
429 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  26.92 
 
 
500 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  25.39 
 
 
413 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  27.25 
 
 
433 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  25.49 
 
 
425 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.55 
 
 
460 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  27.49 
 
 
429 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  25.28 
 
 
420 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
406 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  25.79 
 
 
500 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 
395 aa  57  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  26.69 
 
 
418 aa  57  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  28.1 
 
 
435 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  24.58 
 
 
409 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  26.7 
 
 
417 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  25.66 
 
 
438 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
460 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  29.04 
 
 
435 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  24.86 
 
 
500 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  24.93 
 
 
420 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 
426 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3474  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
415 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00256717  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  29.07 
 
 
439 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  26.76 
 
 
428 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2876  alpha-ketoglutarate permease  24.46 
 
 
440 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 
410 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  25.21 
 
 
420 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 
219 aa  53.5  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  24.52 
 
 
460 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  23.58 
 
 
500 aa  53.1  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  25.21 
 
 
420 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  25.21 
 
 
420 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  24.47 
 
 
432 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  24.47 
 
 
432 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  28.78 
 
 
442 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  24.47 
 
 
432 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  28.25 
 
 
437 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  27.09 
 
 
441 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  28.24 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 
437 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  31.14 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 
442 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>