More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1329 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 394 aa  760    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  56.6 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  52.79 
 
 		 390 aa  378  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  53.57 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  52.28 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  52.79 
 
 		 390 aa  368  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  51.75 
 
 		 414 aa  353  4e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 		 390 aa  338  7e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 407 aa  135  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 434 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 409 aa  113  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2430  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3635  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 441 aa  106  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1616  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0319  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 409 aa  97.4  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 412 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1899  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2559  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.3 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.23 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  33.33 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1536  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.75 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.32 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 472 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 433 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 474 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  27.08 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.54 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  28.1 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  26.69 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  25.99 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 790 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1455  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  34.42 
 
 		 540 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  33.59 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  25.24 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1257  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 462 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.375741  hitchhiker  0.00856521 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 473 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  27.92 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>