102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1455 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1455  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 394 aa  749    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  56.62 
 
 		 386 aa  409  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1899  major facilitator superfamily MFS_1  56.81 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  52.35 
 
 		 390 aa  352  5e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1616  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0033  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  35.21 
 
 		 480 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1550  major facilitator superfamily transporter  30.06 
 
 		 426 aa  53.5  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0416  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3635  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  25.88 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1184  hypothetical protein  24.63 
 
 		 387 aa  50.8  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.497488  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0319  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 443 aa  49.7  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 451 aa  49.7  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 395 aa  49.7  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  25.09 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  24.43 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7916  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  21.69 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.44 
 
 		 384 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0748  citrate-proton symporter  25.45 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.93839 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0809  citrate-proton symporter  25.45 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.511471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0845  citrate-proton symporter  25.45 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0736  citrate-proton symporter  25.45 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0796  citrate-proton symporter  25.45 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  30.11 
 
 		 476 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 418 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 418 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 440 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 440 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2149  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 443 aa  46.2  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00239226  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  34.35 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.27 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  32.82 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24770  arabinose efflux permease family protein  29.07 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  34.35 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  26.39 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3423  hypothetical protein  22.44 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  21.88 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 447 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  30.53 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 474 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  26.87 
 
 		 403 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  32.56 
 
 		 499 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.08 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0861  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.605059 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 219 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 439 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  21.61 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  22.43 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 422 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2718  hypothetical protein  23.47 
 
 		 384 aa  43.5  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 425 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  28.95 
 
 		 431 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  28.95 
 
 		 431 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  27.66 
 
 		 465 aa  43.1  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 386 aa  43.1  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 427 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 425 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  24.83 
 
 		 418 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 391 aa  42.7  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 432 aa  42.7  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>