More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2149 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2149  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
443 aa  836    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00239226  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  51.97 
 
 
448 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  53.51 
 
 
446 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 
438 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  51.86 
 
 
442 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  51.46 
 
 
418 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 
423 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  52.38 
 
 
398 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  48.41 
 
 
437 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  50.61 
 
 
447 aa  356  5e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  53.02 
 
 
428 aa  355  7.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4727  major facilitator superfamily MFS_1  54.3 
 
 
441 aa  350  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3651  major facilitator transporter  49.53 
 
 
426 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3724  major facilitator superfamily transporter  49.53 
 
 
426 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.517279 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  48.1 
 
 
442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  46.79 
 
 
447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  51.79 
 
 
460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  46.34 
 
 
423 aa  296  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0829  major facilitator superfamily MFS_1  46.9 
 
 
430 aa  282  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145147  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  41.82 
 
 
439 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  45.52 
 
 
446 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  39.23 
 
 
430 aa  239  9e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 
486 aa  236  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5436  major facilitator superfamily MFS_1  38.97 
 
 
411 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  31 
 
 
434 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 
437 aa  116  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  26.8 
 
 
430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  26.8 
 
 
430 aa  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
439 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  28.35 
 
 
417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
441 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  28.61 
 
 
428 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  31.76 
 
 
428 aa  99.8  8e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  31.76 
 
 
428 aa  99.8  8e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  25 
 
 
445 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  28.75 
 
 
432 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
421 aa  97.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  27.61 
 
 
434 aa  97.1  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  27.7 
 
 
430 aa  96.7  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  28.28 
 
 
430 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  27.61 
 
 
434 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  27.47 
 
 
428 aa  91.3  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  25.66 
 
 
443 aa  91.3  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  25.66 
 
 
443 aa  90.5  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  24.16 
 
 
432 aa  90.1  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  23.91 
 
 
432 aa  90.1  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  24.16 
 
 
452 aa  90.1  8e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  27.2 
 
 
428 aa  89.7  9e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  27.66 
 
 
434 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  24.16 
 
 
452 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  26.23 
 
 
432 aa  88.2  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  26.03 
 
 
432 aa  88.2  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  27.88 
 
 
407 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  27.58 
 
 
412 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  27.35 
 
 
425 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  27.35 
 
 
425 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  26.33 
 
 
366 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  26.04 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  25.35 
 
 
431 aa  80.9  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  31.12 
 
 
414 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  26.77 
 
 
418 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  25 
 
 
431 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
425 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  29.52 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  24.3 
 
 
443 aa  77.4  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
415 aa  77  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  28.57 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  23.61 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 
446 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  27.24 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  23.54 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  27.73 
 
 
429 aa  73.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2985  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.124537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  29.65 
 
 
427 aa  73.2  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  25.38 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  28.26 
 
 
437 aa  72.8  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  25.38 
 
 
422 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  25.52 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  24.82 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  25.47 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  27.15 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  25.28 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  24.87 
 
 
453 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
431 aa  67  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  25.47 
 
 
420 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  25.71 
 
 
418 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  26.72 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  30.29 
 
 
446 aa  64.3  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  30.29 
 
 
446 aa  64.3  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  25.88 
 
 
451 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  32.93 
 
 
461 aa  63.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  24.42 
 
 
448 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>