133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0751 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 398 aa  764    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  71.86 
 
 		 398 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6287  major facilitator superfamily permease  42.54 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1181  MFS family transporter  42.58 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13070  MFS family transporter  42.58 
 
 		 393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  24 
 
 		 429 aa  99.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 399 aa  67  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  34.36 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  32.53 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  32.48 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8658  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 407 aa  57  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 394 aa  57  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  32.72 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0290  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 420 aa  54.3  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  25.93 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 403 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 390 aa  53.1  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  29.41 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  28.91 
 
 		 905 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2962  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 462 aa  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 400 aa  49.7  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  28.92 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 460 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 410 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  30.67 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.88 
 
 		 459 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  33.72 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 472 aa  47.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 391 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  24.86 
 
 		 448 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 383 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  24.86 
 
 		 448 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1649  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 425 aa  46.6  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  29.23 
 
 		 582 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  25 
 
 		 436 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 442 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 450 aa  46.6  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 553 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2964  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.413021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  32.26 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  31.11 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  25 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.79 
 
 		 474 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2971  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.74 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4405  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  24.66 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  24.06 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1322  major facilitator superfamily transporter  28.8 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0763  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000770218  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 459 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0007  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  25.65 
 
 		 447 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.265012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 483 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1571  alpha-ketoglutarate permease  24.69 
 
 		 634 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  26.42 
 
 		 439 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.28 
 
 		 587 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.16 
 
 		 455 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  24.06 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  24.06 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>