More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2602 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4237  major facilitator superfamily MFS_1  97.87 
 
 
422 aa  755    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
422 aa  826    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5855  major facilitator superfamily transporter  63.96 
 
 
420 aa  485  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1445  major facilitator transporter  64.52 
 
 
419 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804439  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0900  major facilitator transporter  62.86 
 
 
420 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1463  major facilitator superfamily transporter  64.52 
 
 
419 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0911464  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4559  major facilitator transporter  64.83 
 
 
421 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4198  major facilitator transporter  64.9 
 
 
418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4264  major facilitator superfamily transporter  64.9 
 
 
418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396919  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4425  major facilitator transporter  64.9 
 
 
418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226942  normal  0.426578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10866  integral membrane transport protein  62.81 
 
 
419 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.25313  hitchhiker  0.00190628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  52.05 
 
 
425 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2309  major facilitator transporter  53.5 
 
 
426 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.559549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4586  major facilitator transporter  53.5 
 
 
426 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101779  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4715  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 
413 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  33.74 
 
 
412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0291  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 
411 aa  209  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  34.98 
 
 
415 aa  193  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 
415 aa  192  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  35.34 
 
 
415 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 
395 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1048  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 
477 aa  155  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137816  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  28.98 
 
 
401 aa  149  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  28.32 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  27.71 
 
 
393 aa  137  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  27.78 
 
 
393 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  27.94 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  27.94 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  27.94 
 
 
401 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  28.17 
 
 
401 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  28.17 
 
 
401 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  28.17 
 
 
401 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  30.28 
 
 
408 aa  133  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  26.8 
 
 
395 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  28.65 
 
 
398 aa  132  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  28.1 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  31.39 
 
 
414 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  27.42 
 
 
401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  26.79 
 
 
402 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  26.79 
 
 
402 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  27.93 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  27.93 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  27.93 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  27.93 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  28.49 
 
 
397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  27.66 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  26.53 
 
 
402 aa  126  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.182289 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  26.53 
 
 
402 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
402 aa  126  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  26.53 
 
 
402 aa  126  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  26.53 
 
 
402 aa  126  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  26.53 
 
 
402 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  26.53 
 
 
402 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0239  multidrug resistance protein MdtH  24.4 
 
 
411 aa  124  3e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  28.15 
 
 
401 aa  124  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  25.25 
 
 
393 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  26.63 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2276  multidrug resistance protein MdtH  26.63 
 
 
398 aa  116  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
406 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4504  hypothetical protein  53.54 
 
 
158 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.8 
 
 
424 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4228  hypothetical protein  27.51 
 
 
443 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.06951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  25.41 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25.41 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  26.63 
 
 
424 aa  86.7  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.59 
 
 
423 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  25.07 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  25.07 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  25.07 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  25.07 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  24.04 
 
 
423 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  25.07 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  22.34 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  22.79 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5044  major facilitator transporter  23.92 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.09 
 
 
392 aa  63.9  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  33.33 
 
 
434 aa  62.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 
455 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
454 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  26.87 
 
 
416 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  28.28 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  22.28 
 
 
419 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
457 aa  60.1  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  27.62 
 
 
460 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  27.62 
 
 
460 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  28.25 
 
 
442 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 
464 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  27.62 
 
 
464 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  29.94 
 
 
412 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  26.77 
 
 
413 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  22.81 
 
 
485 aa  57.4  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  29.03 
 
 
454 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  29.03 
 
 
456 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  29.03 
 
 
454 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  26.77 
 
 
412 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  26.77 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  27.1 
 
 
432 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2875  major facilitator transporter  22.7 
 
 
517 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>