More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2606 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  100 
 
 		 412 aa  788    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  60.78 
 
 		 407 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  62.79 
 
 		 398 aa  434  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  41.01 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  42.94 
 
 		 445 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  40.73 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 		 419 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  38.67 
 
 		 416 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  36.06 
 
 		 433 aa  192  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 471 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  31.35 
 
 		 432 aa  169  8e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  30.16 
 
 		 423 aa  141  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 395 aa  140  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  28.17 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  28.42 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  29.38 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  29.38 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  29.38 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  29.38 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 404 aa  130  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 412 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  28.87 
 
 		 423 aa  127  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  28.17 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  28.45 
 
 		 423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  26.58 
 
 		 424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 419 aa  113  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0324  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  24.94 
 
 		 402 aa  97.1  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  27.17 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10859  integral membrane protein  28.3 
 
 		 442 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000464176 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  26.11 
 
 		 405 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 401 aa  93.6  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 419 aa  92.8  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  25.74 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  25 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  25.14 
 
 		 413 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 399 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 412 aa  86.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  25.25 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  23.65 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  22.52 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  23.02 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  22.52 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  26.01 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  21.45 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  22.22 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  22.37 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  22.22 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  21.94 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  22.88 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  21.94 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  21.94 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  21.94 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  22.4 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  21.94 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  21.94 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  23.8 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  21.85 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  21.27 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 408 aa  72.8  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  22.22 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  24.73 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  21.33 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  24.08 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0996  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825084  normal  0.507459 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  21.33 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  21.33 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  22.53 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  21.45 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2918  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>