142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0659 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
376 aa  724    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0417  major facilitator transporter  43.67 
 
 
364 aa  259  7e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.117512  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0996  major facilitator transporter  39.79 
 
 
389 aa  258  1e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825084  normal  0.507459 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  25.95 
 
 
395 aa  133  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  25.76 
 
 
423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2587  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
382 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  27.06 
 
 
416 aa  88.2  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  23.78 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2014  major facilitator superfamily permease  25.07 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  24.16 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  24.35 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  24.16 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  24.68 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  22.53 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  24.61 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  24.61 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  23.62 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  24.61 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  24.61 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  24.16 
 
 
397 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  22.85 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  22.28 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  24.38 
 
 
423 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  24.36 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  23.39 
 
 
424 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  23.29 
 
 
423 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  23.84 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  23.84 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  23.84 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  23.84 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  24.36 
 
 
393 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  24.36 
 
 
393 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.72 
 
 
424 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  22.25 
 
 
424 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  23.29 
 
 
423 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.18 
 
 
423 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  23.68 
 
 
381 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  26.36 
 
 
413 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  25.79 
 
 
412 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
419 aa  63.2  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  23.49 
 
 
397 aa  63.2  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  25.79 
 
 
412 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 
406 aa  62.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  24.49 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  22.94 
 
 
405 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 
399 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  24.43 
 
 
402 aa  60.5  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 
401 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  24.35 
 
 
397 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  23.37 
 
 
423 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  25.21 
 
 
412 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  25.35 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 
419 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 
421 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  25.34 
 
 
404 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 
445 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  24.41 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  24.07 
 
 
395 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  27.54 
 
 
412 aa  56.2  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  24.16 
 
 
395 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  24.16 
 
 
395 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  24.16 
 
 
395 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 
395 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  22.88 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  24.16 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0142  major facilitator transporter  25.15 
 
 
390 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.697552  hitchhiker  0.00487826 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  23.71 
 
 
407 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  23.6 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  23.6 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  24.16 
 
 
395 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1065  major facilitator superfamily MFS_1  21.43 
 
 
404 aa  54.3  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  23.23 
 
 
429 aa  53.1  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  28.93 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  28.93 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  24.36 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
426 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  20.29 
 
 
417 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  23.83 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  19.89 
 
 
401 aa  51.2  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  24.1 
 
 
438 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0136  major facilitator superfamily permease  22.83 
 
 
401 aa  50.1  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  21.65 
 
 
409 aa  50.1  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 
412 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  22.07 
 
 
392 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  22.07 
 
 
404 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  24.16 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  24.16 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  24.84 
 
 
462 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  23.83 
 
 
395 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2439  hypothetical protein  30.28 
 
 
408 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  20.44 
 
 
417 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  22.19 
 
 
398 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 
410 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 
433 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.5 
 
 
461 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  22.07 
 
 
392 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>