More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0571 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
433 aa  846    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  44.93 
 
 
450 aa  339  5e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  47.24 
 
 
450 aa  323  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  41.35 
 
 
410 aa  242  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  37.26 
 
 
419 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  36.06 
 
 
412 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 
445 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  36.17 
 
 
416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  34.35 
 
 
398 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  36.99 
 
 
419 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 
419 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  34.56 
 
 
407 aa  183  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  28.5 
 
 
432 aa  159  8e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  31.89 
 
 
413 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 
420 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
415 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  25.48 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 
412 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 
452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  26.63 
 
 
396 aa  109  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 
417 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
412 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
435 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  24.32 
 
 
424 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
401 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  24.46 
 
 
424 aa  106  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
423 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.34 
 
 
423 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  28.06 
 
 
423 aa  102  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  23.59 
 
 
423 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  23.59 
 
 
423 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  23.59 
 
 
423 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  23.59 
 
 
423 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
428 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  23.56 
 
 
424 aa  99.8  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  23.31 
 
 
424 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23.5 
 
 
423 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  27.15 
 
 
395 aa  97.1  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.66 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
407 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  25.6 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  26.39 
 
 
418 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  25.61 
 
 
418 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  25.21 
 
 
418 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  26.1 
 
 
418 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  25.21 
 
 
418 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  24.8 
 
 
418 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  27.86 
 
 
405 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  25.34 
 
 
418 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.55 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  24.93 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  25.34 
 
 
418 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  24.06 
 
 
393 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  24.06 
 
 
393 aa  87.8  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  24.06 
 
 
393 aa  87.8  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  25.07 
 
 
416 aa  87.4  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  24.93 
 
 
413 aa  87  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  25.54 
 
 
419 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3966  major facilitator transporter  29.85 
 
 
1075 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  24.05 
 
 
412 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  24.05 
 
 
412 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  26.14 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  23.05 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
433 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  24.34 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  24.72 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  24.41 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  24.72 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  24.44 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  24.44 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  24.72 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  26.33 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  24.17 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  24.44 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  24.44 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  22.49 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  23.48 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  25 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  20.94 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  24.44 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 
399 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  23.56 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  23.56 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  20.16 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  21.91 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  23.76 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  23.2 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  21.99 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  19.9 
 
 
412 aa  67  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  20.15 
 
 
412 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  19.44 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  19.44 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  21.09 
 
 
381 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  25.19 
 
 
399 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>