195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8266 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 471 aa  903    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  55.37 
 
 		 413 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  33.59 
 
 		 407 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 412 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 		 419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 450 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 410 aa  133  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  25.18 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 419 aa  103  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 412 aa  101  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25.53 
 
 		 423 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 424 aa  98.2  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  25.53 
 
 		 423 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.87 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  25.34 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.61 
 
 		 423 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.61 
 
 		 423 aa  91.3  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.61 
 
 		 423 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.61 
 
 		 423 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 424 aa  91.3  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0324  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 428 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  24.14 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.14 
 
 		 423 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 460 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  26.49 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  24.53 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  23.42 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10859  integral membrane protein  24.75 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000464176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  21.71 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  23.01 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  21.56 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  22.07 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  21.29 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  23.26 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  23.26 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  21.94 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  22.87 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  22.07 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  25.99 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  20.67 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  21.07 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  20.65 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  23.32 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 409 aa  55.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  22.36 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 480 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 412 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  22.83 
 
 		 404 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  21.53 
 
 		 418 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  21.53 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 407 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  24.49 
 
 		 396 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  22.12 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  20.79 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  22.77 
 
 		 401 aa  50.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 416 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 850 aa  50.1  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25 
 
 		 416 aa  50.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  20.39 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  21.66 
 
 		 685 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  26.61 
 
 		 540 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3300  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.52 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  25.34 
 
 		 405 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  21.81 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  21.81 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>